Είναι γνωστό ότι ο Μάκης Παπαϊωάννου υπέβαλε την παραίτησή του στο Διοικητικό Συμβούλιο της Ομόνοιας από τη θέση του τεχνικού διευθυντή μετά τις τελευταίες εξελίξεις στην ομάδα. Ο ίδιος ανέλαβε το μερίδιο ευθύνης που του αναλογεί και αυτός ήταν και ο λόγος που παραιτήθηκε. 
 
Με παρότρυνση όμως του Γέσπερ Φρέντμπεργκ, ο Μάκης Παπαϊωάννου θα παραμείνει στην ομάδα μέχρι το τέλος της σεζόν, για να δώσει όση περισσότερη βοήθεια χρειαστεί στο έργο του Δανού τεχνικού στα εναπομείναντα παιχνίδια των πλέι οφ.